Когда началась война директор Осипов А.В. провел митинг. Мальчишки выпуска 1941 года вместе с учителями ушли на фронт. И многие не вернулись. В 1943 году на Орловско-Курской дуге погиб учитель математики Куликов Александр Максимович. Не вернулись домой учитель биологии Саломашкин Александр Дмитриевич и учитель математики Грязнов Константин Иванович. Они погибли в 1942 году. Комсорг Андрианов Михаил Трофимович погиб в 1943 году. Похоронен на Пискаревском кладбище в Ленинграде. Не дожили до Дня Победы выпускники 1941 года: Калугин Костя, Сурков Владимир, Смирнов Петр, Прибытков Григорий, Николаев Геннадий, Долгополов Владимир, Петунин Иван, Марков Федор, Павлов Юрий, Хохлов Александр, Богатов Александр, Верин Валентин, Ульянов Дмитрий, Селихова Александра.
С 1941-1947 г. школа была переоборудована под госпиталь. Здесь было два госпиталя : № 2846 и № 3075. В актовом зале сложили печку и он превратился в кухню, классные комнаты- в палаты. Учебные занятия проходили в здании интерната и в красном уголке стрелочного завода. Учились в три смены. Вторая смена заканчивала в 20.00, а третья начиналась в 21.00. Хотя и было печное отопление, но было очень холодно, не хватало дров. Даже чернила замерзали. Электричество экономили и включали не всегда. На столе учителя горела керосиновая лампа, а на партах учеников самодельные керосиновые горелки. В 1941 году, когда фашисты рвались к Москве,учеников всех школ города направляли рыть окопы. В деревню Черемисино шли пешком. Рыли окопы по берегам реки Илемна. В войну работали везде: помогали строить железнодорожную ветку к 5-му км Ковровской линии, работали на торфоразработках на станции Торфопродукт, в вагонном депо делали табуретки для поезда бани , на заводе им. Дзержинского сбивали ящики для снарядов. Ученики собирали бутылки ,которые наполнялись горючей смесью, макулатуру, теплые вещи. И каждый свободный день бежали в наш госпиталь. Раненых было много. Операции делали в бывшей учительской. Многие выздоравливали и уезжали на фронт, но многие умирали от ран. Их хоронили в д. Александровка. Часто останавливался поезд и сгружали умерших прямо на насыпь, а потом на лошадях колхозники везли трупы на кладбище. Мы ухаживали за ранеными, давали концерты, писали письма им домой, читали газеты. Только в 1947 году мы снова стали учиться в школе. Но еще долго пахло лекарством.